Одним з найважливіших завдань служби щодо карантину рослин є охорона рослинних ресурсів країни, недопущення поширення й шкодочинності основних карантинних організмів – збудників хвороб, шкідників і бур’янів.

Контролю над експортом підкарантинних матеріалів, які вивозяться за межі України відводиться дуже велика роль. Вони повинні відповідати умовам, що передбачені відповідними міжнародними договорами, супроводжуватися фітосанітарними сертифікатами і оформлені згідно з міжнародними стандартами для фітосанітарних заходів. Фітосанітарний сертифікат засвідчує відсутність у підкарантинних матеріалах карантинних та інших шкідливих організмів, що передбачено вимогами країн-імпортерів у торговельних договорах (контрактах), конвенціями і угодами з карантину та захисту рослин.

Тепер, коли Україна готується вступати до Світової організації торгівлі (СОТ), потрібно привести існуючі нормативні документи у відповідність з міжнародними вимогами. На сьогодні існує три основні тексти документів, які визначають нормативно-правові вимоги з фітосанітарного карантинного контролю у всіх країнах світу. Ці вимоги є фундаментальними принципами, на яких побудовані національні правила та законодавства з карантину рослин в кожній окремо взятій країні. Цими основними документами є:

Міжнародна конвенція щодо захисту рослин; Угода Світової організації торгівлі про застосування санітарних та фітосанітарних заходів, принципи карантину рослин, пов’язані з міжнародною торгівлею (міжнародні стандарти з фітосанітарних заходів).

Суб’єкти міжнародної торгівлі повинні неухильно дотримуватися встановлених міжнародними конвенціями вимог до фітосанітарного контролю.

Для отримання фітосанітарного сертифікату особа зобов’язана підготувати партію вантажу відповідно до вимог країни-імпортера і не пізніше, ніж за 30 днів до відвантаження підкарантинних матеріалів подати до державної інспекції з карантину рослин, за місцем їх вирощування або відвантаження, заяву про оформлення фітосанітарного сертифікату. А також копію зовнішньоекономічного контракту та документ про проведену оплату.

Не пізніше ніж за 5 днів до відвантаження вантажовласник зобов’язаний пред’явити партію підкарантинних матеріалів для карантинного огляду та фітосанітарної експертизи державному інспектору з карантину рослин. Термін дії фітосанітарного сертифікату – 14 діб.

Експортні партії підкарантинних матеріалів, що заражені карантинними або іншими шкідливими організмами, до експорту не допускаються і підлягають знезараженню.

Форма та порядок заповнення фітосанітарних сертифікатів повинна повністю відповідати формі та порядку, встановленим Міжнародною конвенцією з карантину і захисту рослин та міжнародними стандартами для фітосанітарних заходів.